对于砂石脱粉机，常见故障之一是轴承进灰和润滑油泄漏。例如主轴下轴承密封设计不佳时，容易出现此类问题。解决方法是采用新的设计方案，像江苏赛隆的机制砂风选脱粉机，其主轴下轴承密封采用新设计，有效地解决了轴承进灰和润滑油泄漏两项重大问题，延长了轴承使用寿命。
共振问题也较为常见。在设计脱粉机基础时，如果未考虑机械减振原理，分选机基础的振动频率与分选机固有频率可能形成整数倍关系，从而引发共振。解决办法是采用机械减振原理，使分选机基础的振动频率与分选机固有频率不形成整数倍关系，从根本上解决共振问题。
对于养蜂用的实木制脱粉器，可能出现的问题是脱粉效率降低。原因可能是喇叭孔接粉斗被杂物堵塞或者蜜蜂进出不顺畅。解决方式是定期清理脱粉器，检查喇叭孔是否有杂物，确保蜜蜂能够顺利进出脱粉器。
印刷行业的除粉设备，如清水涂布除粉机，可能出现除粉效果低、纸张伸缩变形等问题。这是因为其采用胶辊涂布系统通过胶辊向印刷品涂布清水来除粉，纸面湿度高。解决办法是更换为更先进的除粉设备，如干式高速双面除粉机，其具有双面高速扫粉、吸气吸除扫出粉尘、电热压粉清除油墨层粘帖粉尘等功能，除粉率达到 90% 以上，且能确保印刷面不划伤。
